Malgré ses six titres mondiaux et sa médaille d'argent aux Jeux Olympiques de Pékin, Frédérick Bousquet est un homme très discret comparé à ses camarades de bassins, Camille Lacourt, Amaury Leveaux, ou encore Florent Manaudou. Il est aussi connu pour avoir vécu une histoire d'amour avec Laure Manaudou pendant 5 ans. Parents d'une petite fille prénommée Manon née en 2010, ils se sont séparés en 2013. C'est justement cette image de "compagnon de" que le nageur évoque dans une interview au magazine Entrevue.
Leur relation amoureuse était à l'époque très médiatisée du fait de la popularité de sa compagne au point qu'il n'en soit réduit qu'à cette image. "En sortant avec Laure, je savais qu'il y aurait des conséquences", confie-t-il. "Ce qui m'a gêné, c'est lorsque L'Equipe citait mon nom dans les résultats sportifs, ils précisaient 'compagnon de Laure Manaudou'. Pour la presse sportive, je n'étais plus Frédérick Bousquet, j'étais le mec de Laure qui fait accessoirement de la natation. [...] Ça a été dur à vivre."
Si aujourd'hui, l'athlète est passé à autre chose, Laure Manaudou se retrouve à nouveau sous le feu des projecteurs depuis qu'elle est en couple avec Jérémy Frérot, membre du groupe Fréro Delavega.
